Kvalita vody v bazénu je vždy ve velké míře ovlivněna kvalitou filtrace, respektive schopností zachycení nečistot a výkonem. Desjoyaux používá filtraci, která umožňuje zachytit částice velikosti 6 nebo 15 mikronů a to speciálními filtry z buničitého netkaného materiálu. Jednou z nejdůležitějších vlastností filtrací Desjoyaux je ta, že tyto filtrace nepotřebují žádné rozvody vody kolem bazénu ani žádné místo pro umístění filtru, ať už v garáži, technické místnosti nebo na zahradě v šachtě. Princip filtrací Desjoyaux stojí na tzv.okruhovém čištění vody, tzn.voda je z bazénu nasávána do filtračního bloku vtokovou klapkou-skimmerem. Ten umožňuje nasávání pouze jedním směrem a zabraňuje zpětnému vytékání nečistot do bazénu. Voda poté postupuje přes koš na hrubé nečistoty do filtračního vaku, kde je čištěna. Filtrační vak z netkaného buničitého materiálu se čistí pravidelně jednou za dva až pět týdnů, dle spadu nečistot a kvality vody. Čištění probíhá dvěma způsoby, a to buď proplachem zahradní hadicí nebo sprchou, stejně tak je možné filtr prát v pračce běžným pracím prostředkem na třicet stupňů. V sadě bazénu jsou vždy dva filtrační vaky, tak aby jste jeden mohli používat a jeden čistit, jejich životnost je cca dva až čtyři roky.
Filtrační jednotky se k bazénům Desjoyaux dodávají ve dvou provedení dle Vaší volby ( používáji stejné filtry, stejný způsob a princip čištění , obě jsou kromě jiného vybaveny halogenovými světly ):